Genetically indeterminate

The Auto-organization of Living Organisms

by Sylvie Pouteau (editorial coordination)
january 2007

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DOI : 10.35690/978-2-7592-0098-6

Contemporary biology is called to accommodate the idea that while DNA is involved in the formation of an individual, the other constituents of the organism or of its environment are also determining factors. Nothing is "programmed" as such, and the challenge is to understand how the whole is assembled and structured. Five researchers from different scientific horizons here provide new and complementary insights into the singularity and auto-organization of living systems.
The book includes a discussion glossary covering around thirty key notions, from adaptation to variability.

Préface et remerciements - Isabelle Stengers et Pierre Sonigo

Introduction - Voir, concevoir : le vivant-machine en question -
Sylvie Pouteau
La biologie en mutation
La machine vivante héritée de la physique
L’archétype et le modèle - Le phénomène et l’idée
L’ombre des idées préformées
Du variable à l’émergent
De nouveaux regards sur le vivant
Résonances et convergences
Références bibliographiques
 
Chapitre 1 - Du sens de la variabilité - Nissim Amzallag
 
La physique classique, une science du général
La variabilité est-elle forcément la trace d’un bruit indésirable ?
    Les postulats de la biométrie
    La confrontation avec l’observation
L’individualité, une réalité ignorée
    Les contresens de la moyenne
    La diversité émergente : expression d’un bruit ?
    Individualisation et adaptation
    L’origine de l’individuation
Le coefficient de variation, un paramètre biologique ?
    Variabiité adaptative, plasticité et canalisation
    Degré de redondance dans les régulations
    L’effet silencieux
    Effets directs et indirects
La connectance, une quantification des réseaux d’interaction
    L’approche quantitative de la régression
    Sens des valeurs faibles de r
    Plasticité développementale et relations inter-organes
    Connectance et héritabilité
L’émergence d’une nouvelle réalité
Pour un retour au choix épistémologique
Références bibliographiques
 
Chapitre 2 - Expression aléatoire des gènes au cours de la différenciation cellulaire - Andras Paldi
 
Des facteurs de régulation par milliers
Pas de libre circulation autour des gènes
Des molécules en perpétuel mouvement
Des repères épigénétiques
La différenciation : un processus de variation-sélection ?
Une marche aléatoire vers une différenciation ordonnée
Des modulations métaboliques
Le flux métabolique comme force structurante
Conclusion
Références bibliographiques
 
Chapitre 3 - Multistabilité et épigenèse dans les systèmes biologiques - Michel Laurent
 
L’exemple de l’opéron lactose
    Gènes on-off : une logique et une mécanique binaires
    Prigogine, ou l’opéron dissipatif
    L’effet de « maintenance » : l’expérience clé de Novick @ Weiner
    Un modèle simple
    États stationnaires multiples et hystérèse
    Delbrück, une pensée visionnaire quelque peu oubliée
Bistabilité dans la dynamique des maladies à prions
    Construction du modèle dynamique
    Analyse du modèle : états stationnaires et isoclines nulles
    Des transitions entre états stationnaires extrêmement lentes
    Transitions hystérétiques et transitions irréversibles
    Implications biologiques
La dynamique, un concept ubiquiste et universel
    Dynamiques moléculaires
    Échelle supra-moléculaire
Références bibliographiques
 
Chapitre 4 - Morphogenèse des structures arborisées et conditions physiques d’une croissance biologique auto-organisée - Vincent Fleury
Une petite introduction &ag

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Language(s): French

Publisher: Éditions Quae

Edition: 1st edition

Collection: Update Sciences & technologies

Published: 15 january 2007

EAN13 eBook [ePub]: 9782759212682

EAN13 eBook [PDF]: 9782759200986

DOI eBook [PDF] : 10.35690/978-2-7592-0098-6

Pages count eBook [PDF]: 174

Interior: Two-colour

Reference eBook [ePub]: 02009EPB

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